1、脂肪成活率不高。
脂肪搬迁通过自体脂肪填充实现了丰满结果，但自体脂肪填充的明显劣势是脂肪成活率不高(低于40%)。结果难以准确性高预测。一次性注入大量自体脂肪很容易使移植的自体脂肪失去生命液供应，导致脂肪钙化或硬化。低成活率意味着需要多次提取和填充脂肪，而身体多次经历手术带来的后果实际上是无法预测的。
2、血肿。
若自体脂肪填充操作不当，可能会显著增加面部神经血管密集区域的风险。在脂肪抽取过程中，若医生对受治者的皮肤造成重损伤，容易导致皮下出血。当面部皮下组织或其他部位的微血管因注射而受损，或患者的凝血功能发生异常时，可能形成血肿。在这种情况下，应立即向医生求助。
3、导致生命液漏出。
自体脂肪填充对专業医护人员和手术环境提出了极高的要求。如果医生进行自体脂肪填充手术，吸脂会造成较大的创口，过多的组织损伤会导致出血和皮肤淤血。这是自体脂肪移植患者常见的并发症。一般在睡前需要使用防溢乳垫，这样少量的生命液才会渗出，不会弄脏床单。由生命液渗出引起的皮肤淤血一般无需特殊处理，但会在2-3周内自行消退。
4、脸容易大或小。
凭借专業技能，自体脂肪填充术可以轻松调整脸部轮廓，因为其实施过程类似于一次性交付的拔牙原则。在提取和细胞处理过程中，脂肪细胞与空气接触时间的长短会直接影响其质量。提取的脂肪细胞完整性和圆度至关重要。在注射到面部各部位时，脂肪细胞的排列和注射技术需要熟练的整形外科医生。缺乏丰满苹果肌和丰富经验的医生可能导致双侧吸收不均匀。这也凸显了医生技术水平不足的缺陷。
5、需要多次填充。
自体脂肪移植手术需要多次进行，这也是自体脂肪移植的明显缺陷之一。由于面部不同区域的容纳空间非常有限，移植的脂肪很难存活。不是一次性注射大量自体脂肪来填补面部，而是采用多次注射的方式进行填充。这就意味着患者需要接受多次抽脂和移植手术才能达到理想的结果，这也是自体脂肪移植的缺点之一
6.易感染。
若进行自体脂肪移植手术时，医护人员消毒措施不严格或注射部位存在慢性炎症性疾病，都可能增加术后感染的风险。一般情况下，感染会在手术后的5-7天内发生。患者可能会出现局部感染、红肿和发热等症状。重时，局部皮肤可能出现持续红肿或针孔处不愈合而形成脓包。一旦出现感染迹象，应立即就医，以防止感染蔓延并加重病情。
7、容易导致皮肤凹凸不平。
通常情况下，自体脂肪移植应当遵循多点、少量、均匀分布、避免聚集的原则。此外，注射的深度不宜过浅或过深（过浅容易无结果，过深则结果不佳）。许多女性在手术后3-6个月发现皮肤出现凹凸不平的情况，这表明身体的正常调节机制没有发挥作用。
8、容易使脂肪液化。
过多注射脂肪组织或营养不良破坏脂肪球，会导致脂肪细胞受损液化，终被身体消化或造成脂肪液化危害。需要到医院进行穿刺引流或负压引流。自体脂肪填充这种风险出色避免，一旦发生，解决起来会很麻烦。
9.皮下积液
对静脉回流不良引起的皮下积液自体脂肪填充也有危害。一般发生在术后10-20天，多发生于下肢。一旦发生，到医院吸几次就可以痊愈。
10.脂肪瘤的形成。
很多女孩在填充后也可能会出现脂肪瘤。一旦形成，只能在医院去除。脂肪瘤的形成是皮下注射的颗粒脂肪堆积或脂肪细胞刺激宿主细胞繁殖的结果。
11、易发生硬结。
经过自身脂肪移植手术后，患者可能会面临硬块的风险，这主要是由于脂肪的收缩所导致的，独特的解决方法就是进行第二次手术。问题的根源在于一次性注入了过多的脂肪。注入脂肪的数量完全取决于医生的技术经验。少量注入并不一定有效，而大量注入则可能存在风险。经验很丰富的医生是取得成功的关键。
12.皮肤坏死。
皮肤坏死多见于抽脂部位，这与医生过度抽脂有关。若考虑进行自体脂肪填充，出色选择专業整形外科医生。所有合格的专業医生都可以在卫生部上找到。如果有人做自体脂肪填充后出现皮肤坏死，应尽快就医，以减少明显疤痕的形成。
