全飞秒和半飞秒手术主要在手术原理、手术特点、手术时间、术后恢复时间、术后运动强度和视觉质量等方面存在区别。
1、手术原理：全飞秒手术是完全用飞秒激光完成，通过飞秒激光在角膜层进行两次扫描，从而形成一枚透镜，再通过角膜侧切口，将透镜取出达到矫正近视的目的。半飞秒手术是通过飞秒激光先进行角膜辩的制作，再通过准分子激光对角膜组织进行切削，改变角膜曲率来达到矫正近视的目的。
2、手术特点：全飞秒手术的特点是不需要制作角膜瓣，避免了由于外力所导致的术后角膜辩脱位，适合参军人员或者运动员。手术对角膜神经的破坏较少，从而术后发生千眼症的概率也较低。此外，全飞秒手术生物力学的改变相比与半飞秒手术而言要少，所以全飞秒手术相对于半飞秒手术术后复发率更低，手术后恢复的时间也相对更快。
而半飞秒的特点是可以根据患者的度数以及散光的轴位进行矫正。全飞秒手术不能矫正影响夜视的高阶像差，而半飞秒手术可以矫正，有时全飞秒手术还可以造成额外的高阶像差。
3、手术时间：全飞秒手术因为在一台仪器上就能完成，有经验的医生在患者配合好的情况下，大概5分钟就能完成一台手术；半飞秒手术因为在两台仪器上完成，所需时间要长一些。
4、术后恢复时间： 全飞秒因为切口小，损伤角膜神经也少，术后干眼几率低，整个伤口恢复也更好。半飞秒则损伤角膜神经较多，术后恢复也相对较慢。
5、术后运动强度：全飞秒手术切口小目没有角膜瓣，术后运动不受限，半飞秒手术因为制作了角膜辩，要注意不参加蹦极、拳击等力度大的剧烈运动。
6、视觉质量：全飞秒在安心度、手术方式、术后恢复时间都优于半飞秒，但在视觉质量上个性化半飞秒却优于全飞秒。
全飞秒和半飞秒手术各有其特点和优势，选择哪种术式需要根据患者的具体情况和需求来决定。
